Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccl1P10146 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms