Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CatspereP0DP43 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms