Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NclP09405 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NclP09405 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NclP09405 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NclP09405 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NclP09405 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NclP09405 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms