Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb1P09055 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb1P09055 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms