Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Eb1P04230 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Eb1P04230 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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