Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01662 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P01662 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01662 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01662 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01662 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01662 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01662 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01662 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms