Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01661 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
P01661 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
P01661 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01661 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01661 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01661 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01661 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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