Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01641 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01641 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01641 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01641 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01641 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01641 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01641 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01641 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01641 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms