Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ifnb1P01575 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifnb1P01575 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms