Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CcnkO88874 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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