Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BlmO88700 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BlmO88700 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BlmO88700 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BlmO88700 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BlmO88700 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BlmO88700 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms