Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
CntfrO88507 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CntfrO88507 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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