Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Tnnt1O88346 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnnt1O88346 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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