Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctnnal1O88327 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms