Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp4O70480 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vamp4O70480 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms