Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SfnO70456 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SfnO70456 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SfnO70456 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SfnO70456 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SfnO70456 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms