Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itgb5O70309 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itgb5O70309 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms