Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top3aO70157 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms