Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ChkbO55229 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ChkbO55229 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms