Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trappc3O55013 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms