Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Srpk2O54781 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Srpk2O54781 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms