Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cited2O35740 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms