Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lhx8O35652 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Lhx8O35652 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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