Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stag2O35638 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Stag2O35638 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms