Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc1a6O35544 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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