Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TnxbO35452 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
TnxbO35452 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms