Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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ColqO35348 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ColqO35348 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ColqO35348 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ColqO35348 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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ColqO35348 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ColqO35348 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ColqO35348 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ColqO35348 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ColqO35348 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ColqO35348 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ColqO35348 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ColqO35348 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ColqO35348 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms