Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kpna6O35345 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kpna6O35345 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms