Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Nedd9O35177 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nedd9O35177 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nedd9O35177 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nedd9O35177 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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