Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pitx3O35160 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.5 ms