Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih2O35089 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cnih2O35089 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms