Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Eftud2O08810 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms