Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube3aO08759 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube3aO08759 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms