Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sec22bO08547 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sec22bO08547 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms