Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20939L7N243 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20939L7N243 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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