Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm8888J3QPX5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm8888J3QPX5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms