Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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Gm19965J3QNY8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Gm19965J3QNY8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm19965J3QNY8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Gm19965J3QNY8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms