Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Smim18J3QNP2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Smim18J3QNP2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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