Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc180J3QNE4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms