Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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