Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn34c3J3QJW5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn34c3J3QJW5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn34c3J3QJW5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn34c3J3QJW5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn34c3J3QJW5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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