Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp408H7BX78 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms