Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn20G5E8X0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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