Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sclt1G5E861 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms