Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcf11G3X9Z4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms