Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Arfgef1G3X9K3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arfgef1G3X9K3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms