Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm20517G3UVU6 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms