Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Crocc2F6XLV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Crocc2F6XLV1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms