Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm28305F6U473 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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