Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rnf212F6TQD1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rnf212F6TQD1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms